Dentro del Servicio de Microbiología existen varias Áreas:
- Recepción y procesamiento de muestra
- Bacteriología General, que incluye:
- Hemocultivos.
- Exudados Quirúrgicos.
- Exudados Respiratorios.
- Urocultivos.
- Coprocultivos.
- Infecciones de Transmisión Sexual.
- Antibióticos.
- Epidemiología.
- Helicobacter.
- Micología.
- Micobacterias.
- Parásitos.
- Virología.
- Biología Molecular.
- Serología.
Además, es fundamental la fase de Pre-analítica que incluye la Petición electrónica, la Toma de muestras microbiológicas y la Recepción de las muestras.