El hospital dispone de una Unidad de Larga Estancia que atiende, en régimen de hospitalización completa, a pacientes con Trastorno Mental Grave (TMG) procedentes de las antiguas áreas sanitarias 3, 4 y 5. Las personas con TMG tienen un trastorno psiquiátrico grave, de larga duración, y ven afectado su funcionamiento psicosocial. La finalidad de esta unidad es proporcionar tratamiento rehabilitador a estos pacientes que, por la gravedad de su trastorno y por sus dificultades de manejo, no pueden ser tratados en régimen ambulatorio o han resultado ineficaces otros recursos comunitarios. Los ingresos en Larga Estancia son siempre programados, y para acceder a la lista de espera los pacientes deben estar incluidos en el Programa de Continuidad de Cuidados y ser derivados desde sus respectivos Centros de Salud Mental.
Los pacientes candidatos a ingresar en la unidad de larga estancia son presentados por sus respectivos centros de salud mental en las reuniones de área que se realizan mensualmente. La Oficina Regional de Coordinación de Salud Mental y Adicciones ratifica las derivaciones con la misma periodicidad. Una vez aceptado el ingreso del paciente entra en lista de espera.
La Unidad de Larga Estancia cuenta con 198 plazas distribuidas en seis subunidades.
En todas las subunidades se evalúan periódicamente las capacidades de las personas en todas las áreas de su vida, se valoran los aspectos deficitarios de su funcionamiento y los más conservados, y se reestructura el PIR (Plan Individualizado de Rehabilitación) según se vayan cumpliendo o no los objetivos planteados.