La atención sanitaria hospitalaria, en Alcalá de Henares y los municipios de su área de influencia, se presta en el Hospital Universitario Príncipe de Asturias y en el Centro Integral de Diagnóstico y Tratamiento Francisco Díaz, el centro de especialidades médicas dependiente del hospital.
El Hospital Universitario Príncipe de Asturias está ubicado en el Campus Universitario de la Universidad de Alcalá. El edificio consta de siete plantas con una superficie total construida de 81.930 m². La planta baja y la primera están dedicadas principalmente a las áreas de Urgencias, consultas, quirófanos y Servicios de Admisión, así como Dirección y Gestión. El resto de las plantas se dedica fundamentalmente a la hospitalización y consultas.
El Centro Integral de Diagnóstico y Tratamiento Francisco Díaz incrementa la capacidad diagnóstica y terapéutica de cobertura del hospital desarrollando una destacada actividad asistencial de consultas y de pruebas diagnósticas.
En los accesos al recinto hospitalario existen paradas de autobús urbano e interurbano, y en el recinto del Campus Universitario existe una estación de Cercanías.