Hospitalización:
El Hospital Carlos III dispone de 99 camas de hospitalización distribuidas en tres plantas (3ª, 4ª y 5ª). La Cartera de Servicios en hospitalización abarca las especialidades de Medicina Interna, Neumología y Rehabilitación.
En la planta 2ª se ubican 3 quirófanos de Cirugía Mayor Ambulatoria y 11 camas de Recuperación Post Quirúrgica.
Consultas externas:
En las plantas 1ª y baja se encuentran las consultas para las diferentes especialidades: Alergología, Anestesia, Cardiología, Cirugía general y Aparato digestivo, Cuidados Paliativos, Dermatología, Digestivo, Endocrinología, Medicina Interna, Medicina Tropical, Neurofisiología, Neumología, Neurología, Oftalmología, Oncología familiar y Rehabilitación
Asimimo hay un área de Rehabilitación con Gimnasio, área de Radiodiagnóstico, Farmacia Hospitalaria para dispensación a pacientes externos y una Unidad de extracción de sangre.
El hospital cuenta con unidades específicas como:
- Unidad de Aislamiento de Alto Nivel, referencia en la Comunidad de Madrid
- Unidad de Endoscopias digestivas
- Unidad de Esclerosis Lateral Amiotrófica (ELA), referencia en la Comunidad de Madrid
- Unidad de Medicina de la Adolescencia
- Unidad de Medicina Tropical y del Viajero
- Unidad de Rehabilitación Cardiaca
- Unidad de Retina
- Unidad de Salud Mental con hospital de día
- Unidad de Tabaquismo
Otras áreas del centro son: Admisión, Asuntos Generales, Atención al Paciente y Trabajo Social, Informática, Mantenimiento. Otros: Unidad de calle de la Asociación Española contra el Cáncer (AECC)