Investigadores del Hospital Ramón y Cajal analizan la variabilidad genética del SARS-CoV-2 durante los dos primeros años de la pandemia
BASADO EN DATOS DE MÁS DE 70.000 PACIENTES DE TODA ESPAÑA
Un grupo de investigadores del Hospital Universitario Ramón y Cajal-IRYCIS y del CIBER de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP), liderados por la Dra. África Holguín, revela cómo ha evolucionado el virus SARS-CoV-2, causante del COVID-19 en España, durante los dos primeros años de la pandemia (febrero de 2020-enero 2022), realizado con más de 70.000 secuencias de pacientes procedentes de todas las Comunidades Autónomas de España.
Durante el periodo de estudio, seis linajes principales se extendieron con éxito en España entre 2020 y 2022: A.2, B.1, B.1.177, B.1.1.7 (Alpha), B.1.617.2 (Delta) y B.1.1.529 (Omicron) con distinta presencia en las diferentes Comunidades Autónomas. La Dra. Holguín, junto a sus colaboradores la Dra. Paloma Troyano-Hernáez y el experto en bioinformática Roberto Reinosa, han llevado a cabo el estudio más completo hasta la fecha sobre la variabilidad genética de las 26 proteínas del SARS-CoV-2. Los resultados permiten comprender mejor la evolución viral y la identificación de regiones esenciales para el virus que pueden ser elegidas como potenciales dianas diagnósticas terapéuticas y vacunales.
Más de 70.000 muestras analizadas
El análisis se llevó a cabo con un programa informático (EpiMolBio) diseñado en el Laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH del Instituto Ramón y Cajal para la Investigación Sanitaria (IRYCIS) y del Servicio de Microbiología del centro sanitario. Este programa diseñado por los investigadores de este grupo es capaz de analizar mutaciones en más de 100.000 secuencias de cualquier patógeno o proteína de interés, y ha sido ya empleado para el análisis de secuencias de SARS-CoV-2 de la pandemia global , pero también del VIH-1 (enlace 1, enlace 2 y enlace 3) y VIH-2.
En las más de 70.000 secuencias de SARS-CoV-2 disponibles, la frecuencia global de mutación fue de 1,24x10-5, con una elevada conservación media (>99%), siendo las proteínas no estructurales las más conservadas. Algunos de los cambios detectados estaban relacionados con evasión del sistema inmune, mientras otros se asociaban a un aumento de infectividad viral.
Sólo se detectó una secuencia con una deleción en uno de los residuos de la proteasa viral principal que participan en la unión al inhibidor de la proteasa Paxlovid, recientemente recomendado por la OMS para el tratamiento de pacientes con enfermedad leve o moderada y en riesgo de hospitalización.
Troyano-Hernáez, P.; Reinosa, R.; Holguín, Á. Evolution of SARS-CoV-2 in Spain during the First Two Years of the Pandemic: Circulating Variants, Amino Acid Conservation, and Genetic Variability in Structural, Non-Structural, and Accessory Proteins. Int. J. Mol. Sci. 2022, 23, 6394
Más información sobre la investigación del grupo de la Dra. Holguín en https://www.quecumplanmuchosmas.com/
